模型集成并不僅僅囿于單純地建立模型的連接，它與系統建模過程緊密聯系．關于模型集成的研究因領域人員對模型的理解而有所不同，尤其體現在運籌/管理科學和計算機應用領域人員對此問題的認識上。 模型集成與模型合成一樣針對已有模型，不同的是模型需要修改．所以模型合成是最簡單的模型集成方式．模型集成有兩類廣泛的議題，即結構(scheme)集成和過程(process)或求解器的集成，結構集成指合并兩個模型的體系以創立一個新模型．過程集成指求解過程的連接；簡單地可理解為一個模型的輸入是另一個模型的輸出．問題是求解過程的組織序列是否可以推理出來．這里值得研究的問題很多，如化解沖突、模型表達、求解控制等．這時模型不再被視為黑盒子，而是玻璃盒子．可以訪問模型的全部結構的設計是極為復雜的．目前有關研究主要在化解沖突和模型表達上。